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刚刚发布!万种鱼基因组计划已完成105种基因组测序

9月21日上午,在青岛举行的2019年国际海洋基因组学大会上,10,000种鱼类基因组计划正式向公众发布,部分阶段性成果对外公布。到目前为止,已经收集了324个鱼类样本,对105个基因组进行了测序,并免费发布了10种代表性鱼类的高质量基因组图谱数据。

万种鱼类基因组计划由中国科学院水产生物学研究所、西北工业大学、中国科学院海洋学研究所、乌普萨拉大学、青岛华达海洋和鱼类基因联合发起。该计划预计将持续10年,分为三个阶段,收集10,000种代表性鱼类,绘制10,000种代表性鱼类的基因组图谱,涵盖全球鱼类的所有目和代表性科,建立大规模、高质量的鱼类基因组数据库,重点进行鱼类基因组研究。通过高深度测序构建基因组精细图谱,为鱼类物种多样性保护和经济鱼类育种提供分子基础,为水产养殖和海洋生态保护提供重要的遗传基础。

以半滑舌鳎为例,这是中国第一个完成的鱼类基因组测序项目和全基因组序列图。由于半滑舌鳎雌雄生长差异巨大,雌性个体的生长速度是雄性个体的2-4倍。因此,半滑舌鳎全基因组序列的确定、半滑舌鳎性别特异性或决定基因的寻找以及性别控制生物技术途径的探索,不仅对鱼类性别决定机制的基础研究具有重要的科学意义,而且对半滑舌鳎养殖业的发展也具有很大的应用价值和推广前景。

青岛华达遗传研究所副所长范光义表示:“青岛启动了世界上首个万种鱼类项目,这对提高青岛的海洋知名度起到了重要作用。我们还加快了青岛国家海洋基因库的建设,创建了世界上最大的综合海洋样品、资源和数据中心,并为新的西海岸地区和青岛的海上进攻贡献了BGI的力量。”

海洋基因组学国际会议由青岛西海岸新区管理委员会、深圳华大生命科学研究所和深圳国家基因库主办,迄今已举行两次。2017年9月,青岛华达遗传研究所成立了国际海洋基因组学联盟,并组织了首届海洋基因组学国际会议。2018年10月,第二届海洋基因组学国际会议发布了世界上第一份海洋基因组学白皮书,并与许多国家的学者和该领域的知名教授和专家共同设立了“海洋创新奖”,从而发现了一批杰出的年轻学者。

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